Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SptbP15508 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SptbP15508 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptbP15508 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms