Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm44597-202ENSMUST00000203287 3516 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms