Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctla2aP12399 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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