Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtcP11725 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtcP11725 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms