Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms