Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2-Ab1P01921 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms