Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms