Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Nkd1-202ENSMUST00000169179 4081 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Ptpn20O55082 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Slc22a21-201ENSMUST00000076493 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms