Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KeraO35367 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KeraO35367 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KeraO35367 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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