Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Casq1O09165 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms