Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Usp7-208ENSMUST00000161046 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gm42907-201ENSMUST00000199793 2148 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrkcshO08795 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrkcshO08795 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrkcshO08795 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrkcshO08795 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrkcshO08795 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrkcshO08795 Rhpn2-202ENSMUST00000085556 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrkcshO08795 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 4930509G22Rik-201ENSMUST00000181206 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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PrkcshO08795 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PrkcshO08795 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PrkcshO08795 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PrkcshO08795 Rbm19-201ENSMUST00000031590 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PrkcshO08795 Ston1-207ENSMUST00000163588 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PrkcshO08795 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PrkcshO08795 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PrkcshO08795 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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PrkcshO08795 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PrkcshO08795 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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