Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AlyrefO08583 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
AlyrefO08583 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms