Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms