Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms