Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Usp9yF8VPU6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Usp9yF8VPU6 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
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Usp9yF8VPU6 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms