Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Ctnna3-203ENSMUST00000105441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gucy2d-203ENSMUST00000206435 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Zfp873-204ENSMUST00000210325 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Fam13a-202ENSMUST00000173193 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Igbp1-201ENSMUST00000033570 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Pilrb2-201ENSMUST00000164886 1807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 G3bp2-201ENSMUST00000113127 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Pa2g4-201ENSMUST00000026425 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Stk36-202ENSMUST00000087186 4065 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Zwilch-201ENSMUST00000122091 2957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr333-ps1-202ENSMUST00000218459 1993 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Epha5-203ENSMUST00000113399 5166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Dhx30-202ENSMUST00000111991 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm27813-201ENSMUST00000184343 354 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Igsf1-202ENSMUST00000072037 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm37125-201ENSMUST00000195877 1559 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gabrb2-201ENSMUST00000007797 3989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gcom1-204ENSMUST00000166843 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Btbd16-204ENSMUST00000208593 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms