Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 276.2 ms