Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms