Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms