Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H60cB1B213 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms