Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm8261-201ENSMUST00000119275 1208 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm3473-201ENSMUST00000216911 1096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms