Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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