Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ubl3Q9Z2M6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ubl3Q9Z2M6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms