Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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