Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms