Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Rfpl4-201ENSMUST00000045215 1598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Zfp978-202ENSMUST00000154154 1250 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ms4a4bQ9ES61 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ms4a4bQ9ES61 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ms4a4bQ9ES61 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ms4a4bQ9ES61 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ms4a4bQ9ES61 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ms4a4bQ9ES61 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms