Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms