Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hmg20aQ9DC33 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hmg20aQ9DC33 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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