Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms