Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.8 ms