Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms