Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ccdc47Q9D024 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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