Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Snf8Q9CZ28 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Snf8Q9CZ28 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Snf8Q9CZ28 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Snf8Q9CZ28 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Snf8Q9CZ28 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Snf8Q9CZ28 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Snf8Q9CZ28 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Snf8Q9CZ28 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snf8Q9CZ28 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms