Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Atxn3Q9CVD2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Atxn3Q9CVD2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Atxn3Q9CVD2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Atxn3Q9CVD2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Atxn3Q9CVD2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Atxn3Q9CVD2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Atxn3Q9CVD2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn3Q9CVD2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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