Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms