Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms