Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms