Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms