Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms