Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tsnaxip1Q99P25 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tsnaxip1Q99P25 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms