Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms