Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins4Q99LZ3 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gins4Q99LZ3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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