Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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