Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms