Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms