Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms