Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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