Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd4aQ8CBY1 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms