Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms