Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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